微波干燥杀菌机在应用过程中，具有一系列的优势：能保证粉状产品和生产环境的卫生质量。由于减少了许多手工操作的中间环节，没有流化床干燥时存在的强大气流和剧烈的电机振动，所以，生产过程能较好地保持鸡精等粉状调味品的颗粒的完整性，产生的粉尘数量也大大减少。
微波干燥设备是一种由微波磁控管发出电磁波对物料辐射，物料受这种电磁波辐射的同时会出现每秒24亿5千万次的振荡互相摩擦而发热，它不是传统的传热方式加热，所以微波干燥设备的干燥效率和物料性质有很大关系。
不同一种物料同样的含水率用微波干燥设备来干燥时效率也有所区别，比如有的化工材料它本身吸收微波能力很差，那么这种物料含水率干燥到一定的程度下就特别难干，这种微波干燥设备对这样的物料干燥效率就不高。那么像石墨这种原料，它物料本身吸收微波能力就特别的强，它比一般的物料吸收微波都强，所以它能在几十秒钟内升温至300℃，这种物料使用微波干燥设备干燥效率就非常高。
